Присутствие предназначено для обсуждения актуальных вопросов церковной бытия:

• богословия,
• церковного управления,
• церковного права,
• богослужения,
• пастырства,
• миссии,
• духовного образования,
• религиозного просвещения,
• диаконии,
• взаимоотношений Церкви и общества,
• взаимоотношений Церкви и государства,
•  взаимоотношений Церкви и иных конфессий и религий.

Основной задачей присутствия является предварительное изучение вопросов, рассматриваемых Поместным и Архиерейским соборами, а также подготовка проектов решений по этим вопросам. Решения по предложениям Межсоборного присутствия могут приниматься также Священным Синодом.